ボートの保管庫のことを艇庫といい、京大には２つ艇庫があります。
大艇庫。大艇庫の上は観覧席になっていて、景色を一望することができる。
小艇庫。
その中に所有する大小約７０のボートが置かれており、全国を見てもこれだけの数のボートを持っている大学はなかなかありません。ボートは軽量化のため、カーボン素材でできていて、非常に高価です。500万円以上するものもあり、ボートを雑に扱うことはご法度です。
大艇庫。エイト（8人乗り）やフォア（4人乗り）などが仕舞われている。
こちらは小艇庫。シングル（1人乗り）やダブル（２人乗り）などが仕舞われている
オールももちろん艇庫の中にしまっています。そのほかにも数々のボートの部品、整備するための工具類も豊富にそろっているのが京大の艇庫の特徴です。選手それぞれのロッカーもあります。
オール置き場。京大のオールの色は「濃青」。伝統ある色で、東大の「淡青」と対になっている。
２つの艇庫の間の広場は、艇の整備をしたり、乗艇練習の前後にミーティングをしたりと有効活用されています。
練習後の艇の整備中。写真の通り、大量の艇を置けるほど広いスペースがある